आज, माल (या लोगों को स्थानांतरित करने के लिए) की तलाश करने वाले लोगों को यह महसूस करने की संभावना है कि यह हमेशा परिवहन के केवल एक मोड से चिपके रहने का कोई मतलब नहीं है। उदाहरण के लिए, कार्गो को ट्रक पर एक जहाज से उतारा जा सकता है, जो इसे एक रैलियार्ड में स्थानांतरित करता है, जहां से इसे ट्रेन से देश भर में स्थानांतरित किया जाएगा। इंटरमॉडल परिवहन अधिक कुशल और सस्ता हो सकता है; हालांकि, कुछ मामलों में, इसने गति और विश्वसनीयता के संदर्भ में नुकसान का उच्चारण किया है।
गति
यद्यपि इंटरमॉडल परिवहन अन्य तरीकों की तुलना में अपेक्षाकृत कम लागत का लाभ प्रदान करता है, यह गति का त्याग करके इसे प्राप्त करता है; किसी भी समय कार्गो को यात्रा के तुलनात्मक रूप से धीमी गति से स्थानांतरित करने के लिए स्थानांतरित किया जाता है, उदाहरण के लिए ट्रेनें, जो निश्चित रेल पर संचालित होती हैं जो कि एक सड़क के रूप में प्रत्यक्ष मार्ग के रूप में पेश नहीं करती हैं जो कि एक ट्रक का उपयोग करता है, यह धीमा हो जाता है। चरम दक्षता पर काम करने के लिए, इंटरमॉडल परिवहन को डिपो में प्रतीक्षा करने में लगने वाले समय की मात्रा को कम करना चाहिए ताकि एक नए वाहक के आने या कार्गो के उतारने के लिए समय कम हो।
विश्वसनीयता में कमी
पारगमन के एक से अधिक मोड पर इसकी निर्भरता के कारण, इंटरमॉडल परिवहन भी कम समग्र विश्वसनीयता के अधीन है; जैसे-जैसे विभिन्न साधनों की श्रृंखला बढ़ती है, श्रृंखला के किसी भी लिंक के टूटने की संभावना भी बढ़ जाती है। यह विशेष रूप से समस्याग्रस्त है जब परिवहन का एक तरीका रेल है; खराब मौसम या उपकरण की विफलता से शुरू होने वाली देरी के लिए रेलमार्ग अतिसंवेदनशील होते हैं। इस कारण से, साथ ही गति पर चिंताएं, विश्वसनीय, उच्च गति परिवहन की आवश्यकता वाले शिपर्स इंटरमॉडल सिस्टम पर विचार करने की कम संभावना है।
क्षति
जब भी कार्गो को इधर-उधर करना पड़ता है, तो शिप को नुकसान होने की संभावना होती है क्योंकि माल परिवहन के एक तरीके से दूसरे में स्थानांतरित हो जाता है। सौभाग्य से, इस खतरे को कम किया जा सकता है, लेकिन ऐसा करने में आमतौर पर अधिक ब्रेसिंग और सुरक्षात्मक सामग्री जोड़कर ओवरपैकिंग शामिल होती है जो आमतौर पर पर्याप्त समझी जाती है। यह जोड़ा गया वजन और व्यय आंशिक रूप से फायदे को प्रभावित करता है जो अंतरमॉडल परिवहन ऊर्जा दक्षता और लागत के संदर्भ में है।
उच्च अवसंरचना लागत
इंटरमॉडल माल ढुलाई भी तुलनात्मक रूप से उच्च बुनियादी ढांचे की लागत से ग्रस्त है। कंटेनरीकरण ने माल को परिवहन करने की लागत और कठिनाई को कम कर दिया है; जहाज से एक ही कंटेनर को एक ट्रेन से एक ट्रक में आसानी से स्थानांतरित किया जा सकता है। इन कंटेनरों को संभालना, हालांकि, इसके लिए आवश्यक है कि शिपर्स के पास भारी-भरकम क्रेन और उपकरण हों जो बड़े कंटेनरों में हेरफेर करने के लिए आवश्यक हों; यह बुनियादी ढांचा सभी जगहों पर, विशेष रूप से विकासशील देशों में मौजूद नहीं हो सकता है।
